Amidāze (AMD)
Enzīmi:Ir makromolekulāri bioloģiskie katalizatori, lielākā daļa fermentu ir olbaltumvielas
Amidāze:Katalizē dažādu endogēnu un svešu alifātisku un aromātisku amīdu hidrolīzi, pārnesot acilgrupu uz ūdeni, iegūstot brīvas skābes un amonjaku. Hidroksāmskābes un citas organiskās skābes tiek plaši izmantotas kā zāles, jo tās ir augšanas faktoru, antibiotiku un audzēju inhibitoru sastāvdaļas. Amidāzes var iedalīt R tipa un S tipa acilāzēs atkarībā no katalizatora stereoselektivitātes.
Papildus amīdu hidrolīzes katalizēšanai amidāze var katalizēt arī acila pārneses reakcijas kosubstrātu, piemēram, hidroksilamīna, klātbūtnē.
Amidāzēm ar dažādiem avotiem ir atšķirīga substrāta specifiskums, dažas no tām var hidrolizēt tikai aromātiskos amīdus, dažas no tām var hidrolizēt tikai alifātiskos amīdus, un vēl citas hidrolizē α- vai ω-amino amīdus. Lielākajai daļai amīnu ir laba katalītiskā aktivitāte tikai acikliskiem vai vienkāršiem aromātiskiem amīdiem, bet kompleksiem aromātiskiem savienojumiem heterocikliskajiem amīdiem, īpaši amīdiem ar orto aizvietotājiem, parasti ir zema aktivitāte (tikai dažiem enzīmiem ir labāka katalītiskā iedarbība).
Katalītiskais mehānisms:
| Enzīmi | Produkta kods | Produkta kods |
| Enzīmu pulveris | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidāžu komplekts, katra pa 50 mg, 19 vienības * 50 mg / vienība vai cits daudzums |
| Skrīninga komplekts (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidāžu komplekts, katra pa 1 mg 19 vienības * 1 mg / vienība |
★ Augsta substrāta specifiskums.
★ Spēcīga kirāla selektivitāte.
★ Augsta konversijas efektivitāte.
★ Mazāk blakusproduktu.
★ Vieglas reakcijas apstākļi.
★ Videi draudzīgs.
➢ Enzīmu skrīnings jāveic specifiskiem substrātiem substrāta specifiskuma dēļ un jāiegūst enzīms, kas katalizē mērķa substrātu ar vislabāko katalītisko efektu.
➢ Nekad neļaut saskarties ar ekstremāliem apstākļiem, piemēram: augsta temperatūra, augsts/zems pH līmenis un augstas koncentrācijas organiskie šķīdinātāji.
➢ Parasti reakcijas sistēmā jāiekļauj substrāts un buferšķīdums (optimālais enzīma pH līmenis). Acilgrupas pārneses reakcijas sistēmā jābūt klāt kosubstrātiem, piemēram, hidroksilamīnam.
➢ AMD reakcijas sistēmā jāpievieno pēdējais, nodrošinot optimālu reakcijas pH un temperatūru.
➢ Visiem AMD veidiem ir dažādi optimālie reakcijas apstākļi, tāpēc katrs no tiem ir jāpēta sīkāk atsevišķi.
1. piemērs(1):
Hidrolīzes aktivitāte dažādiem amīda substrātiem
| Substrāts | Konkrēta aktivitāte μmols min-1mg-1 | Substrāts | Konkrēta aktivitāte μmols min-1mg-1 |
| Acetamīds | 3.8 | ο-OH benzamīds | 1.4 |
| Propionamīds | 3.9 | p-OH benzamīds | 1.2 |
| Laktamīds | 12.8 | ο-NH2benzamīds | 1.0 |
| Butiramīds | 11.9 | p-NH2benzamīds | 0,8 |
| Izobutiramīds | 26.2 | ο-Toluamīds | 0,3 |
| Pentānamīds | 22,0 | p-Toluamīds | 8.1 |
| Heksānamīds | 6.4 | Nikotīnamīds | 1.7 |
| Cikloheksanamīds | 19,5 | Izonikotīnamīds | 1.8 |
| Akrilamīds | 10.2 | Pikolīnamīds | 2.1 |
| Metakrilamīds | 3.5 | 3-fenilpropionamīds | 7.6 |
| Prolinamīds | 3.4 | Indol-3-acetamīds | 1.9 |
| Benzamīds | 6.8 |
Reakcija tika veikta 50 mM nātrija fosfāta buferšķīdumā, pH 7,5, 70 °C temperatūrā.
| Amīdi | Hidroksilamīns | Hidrazīns |
| Acetamīds | 8.4 | 1.4 |
| Propionamīds | 18.4 | 3.0 |
| Izobutiramīds | 25,0 | 22.7 |
| Benzamīds | 9.2 | 6.1 |
Reakcija tika veikta 50 mM nātrija fosfāta buferšķīdumā, pH 7,5, 70 °C temperatūrā.
Saistītā reaģenta koncentrācija: amīdi, 100 mM (benzamīds, 10 mM); hidroksilamīns un hidrazīns, 400 mM; enzīms 0,9 μM.
2. piemērs(2):
3. piemērs(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. u.c. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR u.c. Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400–1404.
3. Džens R. C., Džins Dž. Č., Vu Z. M. u. c. Bioorganiskā ķīmija, 2017. g., pieejams tiešsaistē 7.
