amidāze (AMD)
Fermenti:Ir makromolekulārie bioloģiskie katalizatori, lielākā daļa fermentu ir olbaltumvielas
Amidāze:Katalizējiet dažādu endogēno un svešzemju alifātisko un aromātisko amīdu hidrolīzi, pārnesot acilgrupu ūdenī, veidojot brīvās skābes un amonjaku.Hidroksamskābes un citas organiskās skābes plaši izmanto kā zāles, jo tās ir augšanas faktoru, antibiotiku un audzēju inhibitoru sastāvdaļas.Amidāzes var iedalīt R tipa un S tipa acilāzēs pēc katalizatora stereoselektivitātes.
Papildus amīdu hidrolīzes katalizācijai amidāze var arī katalizēt acilpārneses reakcijas blakussubstrātu, piemēram, hidroksilamīna, klātbūtnē.
Amidazei ar dažādiem avotiem ir atšķirīga substrāta specifika, daži no tiem var tikai hidrolizēt aromātiskos amīdus, daži no tiem var hidrolizēt tikai alifātiskos amīdus, bet daži hidrolizēt α- vai ω-aminoamīdus.Lielākajai daļai amīnu ir laba katalītiskā aktivitāte tikai acikliskiem vai vienkāršiem aromātiskiem amīdiem, bet sarežģītiem aromātiskiem amīdiem heterocikliskajiem amīdiem, īpaši amīdiem ar ortoaizvietotājiem, parasti ir zema aktivitāte (tikai dažiem fermentiem ir labāka katalītiskā iedarbība).
Katalītiskais mehānisms:
| Fermenti | Produkta kods | Produkta kods |
| Enzīmu pulveris | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | 19 amidāžu komplekts, katrs 50 mg 19 vienības * 50 mg / vienība vai cits daudzums |
| Pārbaudes komplekts (SynKit) | ES-AMD-1900 | 19 amidāžu komplekts, katrs 1 mg, 19 vienības * 1 mg / vienība |
★ Augsta substrāta specifika.
★ Spēcīga hirālā selektivitāte.
★ Augsta konversijas efektivitāte.
★ Mazāk blakusproduktu.
★ Viegli reakcijas apstākļi.
★ Videi draudzīgs.
➢ Jāveic enzīmu skrīnings specifiskiem substrātiem substrāta specifiskuma dēļ un jāiegūst ferments, kas katalizē mērķa substrātu ar vislabāko katalītisko efektu.
➢ Nekad nesaskarieties ar ekstremāliem apstākļiem, piemēram: augsta temperatūra, augsts/zems pH līmenis un organiskais šķīdinātājs ar augstu koncentrāciju.
➢ Parasti reakcijas sistēmā jāiekļauj substrāts, buferšķīdums (enzīma optimālais reakcijas pH).Acilpārneses reakcijas sistēmā jābūt tādiem kosubstrātiem kā hidroksilamīns.
➢ AMD jāpievieno pēdējais reakcijas sistēmā ar optimālu reakcijas pH un temperatūru.
➢ Visiem AMD veidiem ir dažādi optimālie reakcijas apstākļi, tāpēc katrs no tiem jāturpina pētīt atsevišķi.
1. piemērs(1):
Hidrolīzes aktivitāte dažādiem amīda substrātiem
| Substrāts | Konkrēta darbība μmols min-1mg-1 | Substrāts | Konkrēta darbība μmols min-1mg-1 |
| Acetamīds | 3.8 | ο-OH benzamīds | 1.4 |
| Propionamīds | 3.9 | p-OH benzamīds | 1.2 |
| Laktamīds | 12.8 | ο-NH2benzamīds | 1.0 |
| Butiramīds | 11.9 | p-NH2benzamīds | 0.8 |
| Izobutiramīds | 26.2 | ο- toluamīds | 0.3 |
| Pentanamīds | 22.0 | p- toluamīds | 8.1 |
| Heksānamīds | 6.4 | Nikotīnamīds | 1.7 |
| Cikloheksanamīds | 19.5 | Izonikotīnamīds | 1.8 |
| Akrilamīds | 10.2 | Pikolīnamīds | 2.1 |
| Metakrilamīds | 3.5 | 3-fenilpropionamīds | 7.6 |
| Prolinamīds | 3.4 | Indol-3-acetamīds | 1.9 |
| Benzamīds | 6.8 |
Reakcija tika veikta 50 mM nātrija fosfāta buferšķīdumā, pH 7,5, 70 ℃.
| Amīdi | Hidroksilamīns | Hidrazīns |
| Acetamīds | 8.4 | 1.4 |
| Propionamīds | 18.4 | 3.0 |
| Izobutiramīds | 25.0 | 22.7 |
| Benzamīds | 9.2 | 6.1 |
Reakcija tika veikta 50 mM nātrija fosfāta buferšķīdumā, pH 7,5, 70 ℃.
Saistītā reaģenta koncentrācija: amīdi, 100 mM (benzamīds, 10 mM);hidroksilamīns un hidrazīns, 400 mM;enzīms 0,9 μM.
2. piemērs(2):
3. piemērs(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S. u.c.Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR u.c.Process Biochemistry, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM u.c.Bioorganiskā ķīmija, 2017, pieejams tiešsaistē 7.
